Le territoire du SYAGC est relativement bien préservé. La flore et la faune sur la Gartempe, la Creuse et de leurs affluents sont très riches et diversifiées. La géologie locale joue un rôle majeur dans cette diversité.

La Gartempe amont

Sur la partie amont de la Gartempe, le sous-sol globalement granitique ainsi que le paysage vallonné et boisé favorisent le développement des espèces d’eaux vives comme la Truite fario ou le Cincle plongeur.

La Gartempe aval

Sur la partie aval de la Gartempe et de la Creuse, le sous-sol calcaire et la faible pente favorisent le développement des espèces d’eau moyennement courante de plaine comme la Renoncule aquatique

De nombreuses espèces protégées sont présentes sur le territoire. Le SYAGC réalise des interventions pour préserver la qualité des milieux indispensable à leur développement.