Le territoire du SIAG est relativement bien préservé : la flore et la faune de la Gartempe et de ses affluents sont très riches et diversifiés. Il nécessite alors un travail conséquent de protection de ces espèces qui sont, pour certaines, protégées aujourd’hui :

Les poissons migrateurs
le saumon
la lamproie marine
l’écrevisse à pieds blancs
l’alose

Les animaux
le cingle plongeur
le vespertilion
le rhinolophe
le castor et la loutre

Les plantes
le millepertuis
la doradille
la fritillaire pintade
la doronic